Авиационная дивизия особого назначения была создана в годы Великой Отечественной войны. С 1942 года местом ее дислокации был столичный Центральный аэродром им. М. В. Фрунзе, расположенный на Ходынском поле. В войну летный состав дивизии выполнил более 80 тыс. боевых вылетов. На военно-транспортных самолетах этого авиационного соединения было перевезено 290 тыс. военнослужащих, доставлено войскам 26 тыс. тонн различных грузов. За образцовое выполнение заданий командования Указом Президиума Верховного Совета СССР от 18 августа 1945 года авиационная дивизия была награждена орденом Красного Знамени, а командиру АДОН генерал-майору авиации В. Г. Грачеву было присвоено звание Героя Советского Союза.
К задачам особой важности, непосредственное участие в решении которых принимал личный состав авиационной дивизии, относилось авиационное обеспечение правительственных делегаций СССР на международных конференциях в Тегеране (1943 г.), Потсдаме (1945 г.) и Париже (1946 г.). С 21 февраля 1950 года эта элитная дивизия получила наименование 2-ой авиационной Краснознаменной дивизии особого назначения (2-я АКДОН).